Identifican nuevas variantes geneticas asociadas al Alzheimer : Trending de Colombia
Los investigadores han aplicado la secuenciacion del genoma completo para identificar genes especificos y cambios geneticos de interes en regiones geneticas previamente asociadas al Alzheimer, con el fin de fundamentar futuras estrategias de tratamiento y prevencion, y han identificado nuevas variantes geneticas asociadas a la enfermedad, segun publican en la revista Alzheimer’s & Dementia.
Identificar las variantes geneticas y el papel que desempeñan en la predisposicion a la enfermedad de Alzheimer puede ayudar a los investigadores a entender mejor como tratar esta dolencia neurodegenerativa para la que actualmente no existe cura.
La investigacion, dirigida por la Facultad de Salud Publica de la Universidad de Boston (BUSPH) y la Facultad de Salud Publica de la UTHealth de Houston (Estados Unidos), utilizo la secuenciacion del genoma completo e identifico 17 variantes significativas asociadas a la enfermedad de Alzheimer en cinco regiones genomicas. Estos datos permiten a los investigadores identificar genes y variantes raros e importantes, a diferencia de los estudios de asociacion del genoma completo, que se centran unicamente en variantes y regiones comunes.
“Estudios previos de asociacion genomica que utilizaban variantes comunes han identificado regiones del genoma, y a veces genes, que se asocian con la enfermedad de Alzheimer -afirma la Dra. Anita DeStefano, coautora del estudio y profesora de bioestadistica en BUSPH-. Los datos de la secuencia del genoma completo interrogan a cada par de bases del genoma humano y pueden proporcionar mas informacion sobre que cambio genetico especifico en una region puede estar contribuyendo al riesgo o a la proteccion de la enfermedad de Alzheimer”.
Para el estudio, los investigadores realizaron analisis de asociacion de variantes unicas y pruebas de asociacion de agregacion de variantes raras utilizando datos de secuenciacion del genoma completo del Proyecto de Secuenciacion de la Enfermedad de Alzheimer (ADSP), una iniciativa genetica que los Institutos Nacionales de Salud desarrollaron en 2012 como parte del objetivo de la Ley del Proyecto Nacional de Alzheimer para tratar y prevenir la enfermedad.Los datos del ADSP incluyen mas de 95 millones de variantes entre 4.567 participantes con o sin la enfermedad.
Entre las 17 variantes significativas que se relacionaron con la enfermedad de Alzheimer, la variante KAT8 fue una de las mas notables, ya que se asocio con la enfermedad tanto en el analisis de variantes unicas como en el de variantes raras. Los investigadores tambien hallaron asociaciones con varias variantes raras de TREM2.
“Al utilizar la secuenciacion del genoma completo en una muestra diversa, pudimos no solo identificar nuevas variantes geneticas asociadas con el riesgo de padecer la enfermedad de Alzheimer en regiones geneticas conocidas, sino tambien caracterizar si las asociaciones conocidas y nuevas se comparten entre poblaciones”, afirma la Dra. Chloe Sarnowski, codirectora y autora del estudio y profesora adjunta del Departamento de Epidemiologia de la Facultad de Salud Publica de la UTHealth Houston.
El ADSP incluye participantes de diversas etnias, y las evaluaciones especificas de la poblacion se centraron en los subgrupos de raza blanca/ancestria europea, negros/afroamericanos e hispanos/latinos, asi como en un metaanalisis multipoblacional. “Incluir participantes que representen una ascendencia genetica diversa y entornos diversos en terminos de determinantes sociales de la salud es importante para comprender el espectro completo del riesgo de padecer la enfermedad de Alzheimer, ya que tanto la prevalencia de la enfermedad como las frecuencias de las variantes geneticas pueden diferir entre poblaciones”, resalta DeStefano.
En futuros estudios, los investigadores esperan examinar las variantes especificas de la poblacion que identificaron en muestras de tamaño mucho mayor, asi como explorar como afectan estas variantes al funcionamiento biologico.
“Actualmente estamos trabajando en la ampliacion de esta investigacion para poder utilizar la secuenciacion de todo el genoma con muestras de mayor tamaño en el ADSP y asi poder examinar el conjunto completo de variantes geneticas, no solo dentro de las regiones geneticas conocidas de la enfermedad de Alzheimer, sino en todo el genoma”, concluye la Dra. Gina Peloso, coautora principal y profesora asociada de bioestadistica en BUSPH.
